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四進(jìn)制造物主

第一百零五章 生命禁區(qū)

四進(jìn)制造物主 非奇異矩陣 2285 2023-02-02 23:47:20

  果然,一切都充滿“驚喜”,。

  邁過那道加大加寬的黃色屏蔽門后,,映入眼簾的是四個(gè)紅色大橫幅,上面寫著:

  頭上懸著三把劍:

  如何逆轉(zhuǎn)非編碼區(qū)基因變異進(jìn)程,?

  腺病毒究竟如何通過影響非編碼RNA影響植物,?

  倒計(jì)時(shí)2555天。

  盧赫掐著指頭算了算,,2555天差不多是7年,。

  不是還有13年嗎,怎么還縮水了呢,?這可不是什么好消息,。

  滿腹狐疑地經(jīng)過那套熟悉的復(fù)雜流程,他來到了實(shí)驗(yàn)室內(nèi),,明亮的燈光刺得他睜不開眼睛,。

  這些鑲嵌在吊頂上的巨大燈管,散發(fā)著一種奇異的色彩,。他很久沒見到過如此通透的白色了,。

  適應(yīng)了光線之后,他發(fā)現(xiàn)在一排空蕩蕩的生物安全柜前站著一個(gè)熟悉而陌生的身影,,正抬頭直視著頭頂?shù)臒艄?,看得很入神?p>  他悄悄走過去,繞到對(duì)方側(cè)面,,果然是一張熟悉的臉,。

  “你又挺過來了?可喜可賀啊?!彼滩蛔≌{(diào)侃道,。即便在知道事情原委之后,他早已對(duì)曾經(jīng)把他給折騰不輕的事情釋然了,,但面對(duì)眼前的枯槁小老頭,,還是沒忍住。

  對(duì)方?jīng)]有回應(yīng)他,,依然抬頭望著燈,,自顧自地說:“看到這些純白色的燈了嗎?多么純凈的顏色,?!?p>  “日光燈誰沒見過?汞蒸氣產(chǎn)生紫外光,,紫外光轟擊熒光粉后的二級(jí)光子,,就是純凈的白光。好看舒服但是費(fèi)電,,奢侈,!”盧赫忍不住批判。

  對(duì)方搖了搖頭,,“這可不是日光燈,,而是節(jié)能LED。藍(lán)色自發(fā)光材料的催化過程被攻克了,,全光譜LED已經(jīng)開始量產(chǎn),。即便維持能源現(xiàn)狀,以后所有人也都能擁有燈光自由,?!?p>  盧赫不以為然地點(diǎn)了點(diǎn)頭。他對(duì)這些并不感冒,,心里滿滿都是對(duì)7年倒計(jì)時(shí)的疑惑,,“門口的標(biāo)語看到了吧,倒計(jì)時(shí)只有7年,,為什么,?”

  對(duì)方把目光投在盧赫臉上,緩緩開口:“因?yàn)槲覐淖詈笠淮伪痪庉?,到第一次發(fā)病,,期間間隔了7年多?!?p>  盧赫愣了一下,,“我們的基因相似度大概還剩99.6%,,你的現(xiàn)在是多少?”

  “時(shí)間太久遠(yuǎn),,我無法考究到我的原始基因組,,我目前的基因組和時(shí)間間隔最久的一次,相似度是99.2%,?!?p>  “呦呵,那??偰V匕?,再過幾個(gè)月,你和最初的你說不定就生殖隔離了,!”

  對(duì)方的臉上飄過一絲無奈,,“我正好要找你,我們正在建立數(shù)據(jù)集,,需要我盡可能多的基因組數(shù)據(jù),。2年前你跑到我公司揪下來的我的頭發(fā),,還有沒有,?”

  盧赫轉(zhuǎn)了轉(zhuǎn)眼珠,“沒了,,不過我可能還有測(cè)序結(jié)果,,在我家里放著?!?p>  “放哪里了,,我讓人去取一下?!睂?duì)方語氣驚喜,。

  “沒必要?!北R赫回憶起往事,,“我當(dāng)初從你頭發(fā)里提了三組基因,分別寄給三個(gè)公司測(cè)序,,其中就有你們公司,。你調(diào)下數(shù)據(jù)就行?!?p>  “找過了,,沒有??赡艽笸k姷臅r(shí)候,,損失了,。”

  盧赫無奈道:“我能先問下你們目前是什么思路嗎,?你要搞機(jī)器學(xué)習(xí),?那種不可解釋的黑箱,有用嗎,?”

  對(duì)方點(diǎn)頭認(rèn)可,,“沒錯(cuò),我們就是要做機(jī)器學(xué)習(xí),,而且是具備可解釋性的小樣本機(jī)器學(xué)習(xí),。至于你說的黑箱,就算有些方法是黑箱,,但好用就行了,。

  你們之前用的CRISPR脫靶分析軟件,其實(shí)就用了這種技術(shù),。那是巨硬亞洲研究院前幾年的成果,。

  他們建立了一個(gè)大型的數(shù)據(jù)集,記錄了與給定的向?qū)NA有一項(xiàng)核苷酸不匹配的所有可能的標(biāo)靶區(qū)域里發(fā)生的脫靶活動(dòng),。

  然后把數(shù)據(jù)喂給了一個(gè)兩個(gè)隱藏層的神經(jīng)網(wǎng)絡(luò),,訓(xùn)練出了一個(gè)可以輸出所有潛在脫靶位點(diǎn)的模型。這是一個(gè)生成模型,,可以得到每個(gè)脫靶位點(diǎn)的概率,,據(jù)此計(jì)算脫靶評(píng)分?!?p>  “太普通了,,這只是實(shí)現(xiàn)了一個(gè)二線工具,還有沒有更驚艷的,?”盧赫追問,。

  “有。

  非同源末端連接機(jī)制還記得吧,?剪刀剪完基因序列后,,不管三七二十一直接把斷裂的基因給粘起來。

  這種方式并不常用,,一般都是用同源模板修復(fù),。一方面是剪的時(shí)候可能剪了不止一個(gè)地方,粘的時(shí)候卻可能只粘了其中一個(gè),。另一方面是細(xì)胞不樂意了直接就不粘了,。

  但有團(tuán)隊(duì)利用機(jī)器學(xué)習(xí)算法準(zhǔn)確地預(yù)測(cè)到了細(xì)胞容易修復(fù)的基因位點(diǎn),并用CRISPR和非同源末端連接治了病,。

  為了探索具有代表性的人類基因組序列的修復(fù)產(chǎn)物,,他們?cè)O(shè)計(jì)了一千多個(gè)目標(biāo)位點(diǎn),,特征是向?qū)NA和靶標(biāo)基因,標(biāo)簽是非同源末端連接最終起了修復(fù)作用位點(diǎn),。

  數(shù)據(jù)喂給了一個(gè)看起來結(jié)構(gòu)很復(fù)雜的模型,,訓(xùn)練結(jié)果很是喜人,模型對(duì)11%的向?qū)NA的修復(fù)位點(diǎn)的預(yù)測(cè)準(zhǔn)確率在50%以上,。

  意味著這些向?qū)NA和相應(yīng)靶標(biāo)基因所對(duì)應(yīng)的疾病,,可以用這種方式來治療。

  最終他們治愈了赫曼斯基-普德拉克綜合征,,一種能凝血不足和白化病的遺傳病,。體外測(cè)試的修復(fù)準(zhǔn)確率高達(dá)94%。

  這個(gè)夠驚艷嗎,?”

  盧赫連連點(diǎn)頭,,“夠。這個(gè)思路不錯(cuò),,是不是可以用在你身上,,特征是某時(shí)間點(diǎn)的基因組,標(biāo)簽是未來的變異位點(diǎn),,提前預(yù)測(cè)變異,,在發(fā)病前做修復(fù)?”

  “沒錯(cuò),?!睂?duì)方肯定道。

  “可是這種方式,,用在你一個(gè)人身上好說,其他人呢,?萬一我們未來都要跟你一樣,,總不能每個(gè)人都建一個(gè)模型吧?”

  “也不是不可以,。不過還是希望未來有別的辦法,。這個(gè)思路已經(jīng)被提上日程了,底下四層全是測(cè)序中心的地盤,?!?p>  盧赫露出了難以置信的表情,繼而又滿懷期待地追問,,“也不對(duì)啊,,我記得我當(dāng)初給你測(cè)序的時(shí)候,你突變的位點(diǎn)很多都在編碼區(qū)的,。也許我們和你不一樣,?!?p>  “沒太大差別,前期確實(shí)大都在編碼區(qū),,但后來也往非編碼區(qū)發(fā)展了,。

  非編碼區(qū)早就不是最初認(rèn)知中的“垃圾”區(qū),隨著研究的推進(jìn),,它的重要作用也被逐漸揭示,。之所以我年紀(jì)越大越嚴(yán)重,很可能就是因?yàn)楹笃谕蛔冊(cè)诹朔蔷幋a區(qū),。

  很顯然,,那里不是可以隨意落筆的空白畫布,而是地獄的入口,,是禁區(qū),。”

  對(duì)方說完,,嘆了一口氣,,便又開始仰頭看燈,“我的測(cè)序結(jié)果放在你家哪里,?得盡快派人去取,,樣本本來就不多,數(shù)據(jù)很珍貴,?!?p>  “不用找別人,我自己去吧,,我也不確定在不在,,在哪里?!?p>  不一會(huì)兒,,他又從鄭K手里弄到了車鑰匙,還收到了一連串的囑咐:

  四通八達(dá)的隧道只限本市,,去外市有一段路要走地上,。

  除了第110號(hào)掩體以外,其余的都還沒有下移動(dòng)通訊網(wǎng)絡(luò),,沒法定位,,需要熟記地圖。

  這兩天天氣不錯(cuò),,風(fēng)不大,,能見度好,路上也沒人,。但別開太快,,路面有沙子,,滑。

  出去之前,,找后勤給車上加點(diǎn)配重,。

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