第二次忍界大戰(zhàn)中，空之國空忍者村仗著高科技與五大國為敵，被木葉村擊敗,。空忍者村首領(lǐng)神農(nóng)帶著殘余分子遠走海外建設(shè)基地,，猥瑣發(fā)育，積蓄力量,。
死灰復(fù)燃的空忍村眼看連航空母艦都發(fā)展出來了,，磨刀霍霍,，想再等三四年準備充足后，就能展開復(fù)仇大計,。但空忍村因為幾乎與世隔絕，消息閉塞,。得知橫空出世的《堅毅忍者傳》續(xù)集的信息慢了好幾拍,。
奈良鹿九根據(jù)書中少量線索，推測出空忍村余孽大致方位和范圍,。
三代火影猿飛日斬抱著寧可信其有,，不可信其無的態(tài)度。果斷派遣忍者部隊,，遠赴海外偵查,。各種偵查忍者各顯神通，找到空忍村余孽并予以毀滅性打擊,。
空忍村的忍者個體力量和其他忍者村相比,，就是戰(zhàn)五渣。被木葉村忍者部隊摸到老巢突襲后,，一敗涂地,。連航空母艦都被油女一族忍者的蟲子啃食殆盡。
只有少數(shù)幸運兒逃過一劫,，借助飛行機逃跑,。這還是因為遠征的木葉村忍者部隊人數(shù)捉襟見肘的緣故。木葉忍者以少勝多也就算了,，全殲敵人就不可能了,。
空忍村敗得如此輕易，還有一個原因是這種關(guān)鍵時刻,，首領(lǐng)神農(nóng)不在,。群龍無首之下，又無出色人才主持大局,，豈有不敗之理,？
神農(nóng)當(dāng)時之所以不在，是因為他擬定好發(fā)展規(guī)劃后,，就將種田發(fā)展交給手下操心,，自己當(dāng)了甩手掌柜，已經(jīng)十年多沒有回去了,。
這是因為敗給木葉村后,，他就醉心于尋找新的強大力量，比如說尾獸,?？墒俏搏F已經(jīng)被各個忍者村瓜分殆盡,，而且他的正面戰(zhàn)斗力也不強，打不過人柱力,。
但他還有一根救命稻草,，那是他早年偶然間從古籍中得知的關(guān)于零尾、零尾復(fù)活之卷軸的只言片語,，以及關(guān)鍵的束縛零尾力量的術(shù)式,。
因此他對零尾的存在深信不疑，或者說不得不信,，這是他最后的希望,。
他有很高的黑暗醫(yī)療忍術(shù)造詣，也有一定的研究成果,。但是巧婦難為無米之炊,，就差足夠的黑暗查克拉。如果能得到零尾的黑暗查克拉,，他的實力就可以無需日積月累的修行鍛煉,，一步登天。為了得到零尾復(fù)活之卷軸,，他偽裝成流浪醫(yī)生,，潛入各國村子暗中打探消息，但是一無所獲,。
當(dāng)他后知后覺知道《堅毅忍者傳》續(xù)集后,，大感不妙，但為時已晚,。
果然,，后來殘存的舊部聯(lián)系到他。他得知多年心血和基業(yè)一朝覆滅,，氣急攻心,。更令他幾欲吐血的是，木葉村做事滴水不漏,，木葉村忍者在火之國雨林邊境的村莊附近,，找到空忍村遺址吳哥要塞——安克爾·班迪安（王都要塞的意思），并將其摧毀,。
嚴格說來,，這座有足夠能源支撐就能飛行的石頭構(gòu)成的吳哥要塞才是空忍村的主體和象征，本身也是一個究極兵器,。只是當(dāng)年倉皇逃竄的空忍村忍者來不及帶走,，才不得不藏在毒物眾多、危機四伏的雨林,。
神農(nóng)本來還幻想著得到零尾后,，就將零尾的力量作為驅(qū)動吳哥要塞的能源,，讓吳哥要塞成為自己的王座，見證天空霸主空忍村的復(fù)興,。
可是連續(xù)兩個噩耗傳來,，令他一蹶不振，王圖霸業(yè)一場空,。最重要的是,，他老了，所剩時間不足以再次暗中將空忍村發(fā)展起來,，所以雄心不再。
第二場中忍考試后,，對空忍村有所關(guān)注的大蛇丸按圖索驥找上門,，與之密談。
原來,，大蛇丸早年和神農(nóng)有段淵源,。神農(nóng)曾傳授大蛇丸再生之禁術(shù)，但這只是草創(chuàng)階段的不完全的忍術(shù),。
大蛇丸研究這個不完全忍術(shù)已經(jīng)大有所獲,。他之所以得到異乎常人的強大生命力，這個忍術(shù)也是功不可沒,。他相信多年過去,，創(chuàng)始者神農(nóng)應(yīng)該完善了這個忍術(shù)，而且與他的研究方向肯定會有所區(qū)別,，對他而言很有價值,。
大蛇丸很期待神農(nóng)完善的忍術(shù)能帶給他足夠的驚喜，所以垂涎不已,。
并且順便邀請神農(nóng)一起對付木葉村,。敵人的敵人不一定是朋友，但大蛇丸和神農(nóng)本就有一定的交情,，所以有合作的基礎(chǔ),。
可是神農(nóng)雖然對木葉村滿腔怨恨，但他頹廢不已,。
“要我和你一起對付木葉村,？哈，晚了,。我現(xiàn)在要人沒人,，要力量沒力量，你還來找我做什么,？看我笑話嗎,？”
“沒人,？空忍村忍者不是逃出一部分被你召集起來了嗎？”
神農(nóng)慘笑道：“剩下的一點烏合之眾有什么用,？”
“在我的計劃里,，你說的烏合之眾可堪一用，”大蛇丸繼續(xù)蠱惑道,，“木葉村把你害得這么凄慘,，難道你就不想報復(fù)？要說力量的話,，我也有辦法讓你得到力量,。但是作為交換，你將完整的再生之禁術(shù)給我,。別告訴我這么多年過去,，這個忍術(shù)你一點都沒有改進?！?p> 神農(nóng)不屑道：“難道你想給我咒印的力量么,？免了，我還想多活幾年呢,?！?p> “我這次來可不是空手而來，而是給你帶來一份見面禮,，你一定會滿意的,。聽說你一直想要零尾復(fù)活之卷軸，我可是特意帶來了,?！?p> 神農(nóng)激動不已：“此話當(dāng)真？你從哪里找到的,？我還以為是虛妄,。”
零尾也成神農(nóng)的執(zhí)念了,，找了那么多年,，他也不甘心自己的追求是鏡花水月。
大蛇丸一臉怪異：“說出來你可能不信,，是木葉村某個人幫我找到的,。而且他一句話吩咐下去，下面就有人幫他找,。相比之下,，你一個人漫無目的的尋找，簡直是大海撈針,。我真是佩服你的毅力,?！?p> 神農(nóng)差點失心瘋：“木葉村？哈哈哈...我一直想找到的東西竟然在死敵木葉村那里,？而且是木葉村的人找到的,，如此強大的力量木葉村竟然瞧不上。我這些年的追求難道只是一場笑話嗎,？”
其實如果沒有蝴蝶效應(yīng),，按照劇情里時間來看，神農(nóng)大概會兩三年后在木葉村找到零尾復(fù)活之卷軸,。
大蛇丸平靜道：“強大么,？我看過零尾的制造術(shù)式，這種人造尾獸的力量比起正統(tǒng)尾獸差遠了,，不過如此,。也就你當(dāng)個寶貝。而且零尾的力量不僅有隱患,，還無法像尾獸一樣用常規(guī)的封印術(shù)封印在人體被利用，不受控制,?！?p> 在大蛇丸看來，零尾簡直就是坑,。卷軸上說的“在人的內(nèi)心產(chǎn)生黑暗時,，讓零尾附身”實在是模棱兩可。是不是內(nèi)心越黑暗越容易吸引零尾附身,？內(nèi)心黑暗又有什么標(biāo)準,？
大蛇丸自認為他的內(nèi)心不算黑暗，只是別人難以理解他的想法,。曉的那一群人才是內(nèi)心黑暗,。他是曉的叛徒，與曉為敵,。如果他用零尾的力量,，零尾會不會投敵鉆入敵人的懷抱？這種資敵行為,，他就敬謝不敏了,。
“嘿，零尾在木葉村當(dāng)真是明珠蒙塵,，你們都不懂得利用零尾的力量,。”
大蛇丸不置可否：“那么,，合作愉快,?！?p> 于是神農(nóng)和大蛇丸一拍即合，狼狽為奸,。